曹炳章14歲隨父遷居紹興,進中藥鋪學業(yè),從名醫(yī)方曉安7年。清光緒二十八年(1902),開業(yè)行醫(yī)。
光緒三十四年,與何廉臣等創(chuàng)組紹興醫(yī)學會,編輯《紹興醫(yī)藥學報》。1913年,與何廉臣一道創(chuàng)設和濟藥局,主持日常事務,刊行《醫(yī)藥學衛(wèi)生報》,并以身作則,考正傳訛藥品,改革不良炮炙,訂正丸散方書。1927年,任《紹興醫(yī)藥月報》編輯。1929年,受神州醫(yī)藥會紹興分會及紹興中西醫(yī)協(xié)會中醫(yī)部推派,赴上海參加全國醫(yī)藥團體總聯(lián)合會號召的聲愿大會,被推為名譽理事。同年9月,籌組成立紹興縣國醫(yī)公會,并任常務主席。提出“統(tǒng)一病名”及印編“中醫(yī)處方新衡舊稱對照表”等建議,受到醫(yī)藥界的好評。
早年隨父研習藥業(yè)并在紹興經(jīng)營藥品,后從醫(yī)師方曉安,通讀傷寒、內科、本草等名家醫(yī)書,自設診所行醫(yī)。并發(fā)奮購天下醫(yī)書,曾搜集有達3500余種,又向北平、南京、上海、蘇州甚至到國外東瀛選購未藏之醫(yī)籍,藏書樓有“集古閣”。1935年,上海大東書局將其搜集的歷代醫(yī)學古籍,編輯成《中國醫(yī)學大成》,收書365種,1 000冊。擬將出版續(xù)集和三集,合計新舊醫(yī)學書籍4 185種,藥物考證類圖書655種,其中,孤本、珍本、明刻、清抄、明抄等及其日本舊刻本有400余種。1952年,所藏醫(yī)學書籍3400余種全部捐贈給華東軍政委員會衛(wèi)生部。